16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0620 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  68.26 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  35.48 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  33.64 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  29.59 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  27.95 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  28.75 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  30.99 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  29.7 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  28.05 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  28.05 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  28.39 
 
 		 290 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  30.25 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0908  hypothetical protein  32.71 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000303993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>