38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3023 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 367 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  97.82 
 
 		 367 aa  743    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  99.73 
 
 		 367 aa  754    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  87.47 
 
 		 367 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  40.49 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  41.74 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  40.5 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  39.34 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  40.22 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  39.94 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  37.57 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.81 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  34.08 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  34.62 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  34.7 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  34.77 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  32.56 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  34.2 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  35.06 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  31.13 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.04 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.47 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  28.14 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  30.81 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  27.99 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.18 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  29.23 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  28.69 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  29.64 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  27.87 
 
 		 362 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  30.34 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  28.02 
 
 		 362 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  30.72 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  30.23 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  28.15 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  26.32 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  25.48 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  27.27 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>