25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0160 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  98.95 
 
 
304 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  92.68 
 
 
286 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  70.5 
 
 
311 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  44.27 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  39.63 
 
 
259 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  39.73 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  40.18 
 
 
271 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  39.82 
 
 
272 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  39.53 
 
 
241 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  35.98 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  34.97 
 
 
223 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  33.88 
 
 
246 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  31.89 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  29.7 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  28.08 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  29.11 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  29.11 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  26.21 
 
 
194 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  38.36 
 
 
366 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  27.7 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  29.49 
 
 
272 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  27.78 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  33.72 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>