• Click on gene locus tag to view gene information
  • Click on a column header to sort by column

16 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Hoch_0576  CDS  NC_013440  775214  777499  +  2286  hypothetical protein  YP_003265107  unclonable  0.0000228174  normal  0.476347  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1000  CDS  NC_013440  1280958  1285220  +  4263  hypothetical protein  YP_003265493  unclonable  0.00761303  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1055  CDS  NC_013440  1352867  1354867  -  2001  hypothetical protein  YP_003265540  unclonable  0.00001121  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1273  CDS  NC_013440  1679060  1679443  -  384  hypothetical protein  YP_003265726  hitchhiker  0.00123545  unclonable  0.0000000014967  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1274  CDS  NC_013440  1679447  1681051  -  1605  hypothetical protein  YP_003265727  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1508  CDS  NC_013440  2047252  2048211  +  960  serine/threonine protein kinase  YP_003265953  unclonable  0.000000484572  decreased coverage  0.000000495585  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1687  CDS  NC_013440  2296404  2298029  -  1626  hypothetical protein  YP_003266130  unclonable  0.00000265405  unclonable  0.0000000045435  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1688  CDS  NC_013440  2298508  2299350  +  843  hypothetical protein  YP_003266131  hitchhiker  0.00800751  unclonable  0.00000000320129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_2570  CDS  NC_013440  3549418  3552264  -  2847  hypothetical protein  YP_003266997  unclonable  0.0000805341  decreased coverage  0.000000145037  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3134  CDS  NC_013440  4310176  4311711  -  1536  hypothetical protein  YP_003267529  unclonable  0.00000464771  normal  0.438059  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3135  CDS  NC_013440  4311862  4312950  -  1089  hypothetical protein  YP_003267530  unclonable  0.000000937816  normal  0.410686  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3762  CDS  NC_013440  5168740  5172318  -  3579  serine/threonine protein kinase  YP_003268155  unclonable  0.00167797  normal  0.557916  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_4015  CDS  NC_013440  5509790  5513956  -  4167  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  YP_003268407  unclonable  0.00534047  normal  0.454006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_4381  CDS  NC_013440  6006645  6009164  +  2520  hypothetical protein  YP_003268768  unclonable  0.0000556116  normal  0.325935  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_6125  CDS  NC_013440  8381283  8384921  -  3639  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_003270493  unclonable  0.000714594  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_6539  CDS  NC_013440  8972717  8974717  +  2001  hypothetical protein  YP_003270901  unclonable  0.00000789727  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>