• Click on gene locus tag to view gene information
  • Click on a column header to sort by column

15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cmaq_0166  CDS  NC_009954  194286  196706  -  2421  valyl-tRNA synthetase  YP_001540005  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0273  CDS  NC_009954  310057  311964  +  1908  adenylylsulfate reductase subunit alpha  YP_001540111  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0449  CDS  NC_009954  482871  486266  -  3396  DNA-directed RNA polymerase subunit B  YP_001540284  unclonable  0.00000490732  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0475  CDS  NC_009954  514215  514793  -  579  ZPR1-related zinc finger protein  YP_001540310  unclonable  0.00000000000108439  hitchhiker  0.000534132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0579  CDS  NC_009954  609356  610441  +  1086  GHMP kinase  YP_001540410  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0651  CDS  NC_009954  686836  687537  -  702  HhH-GPD family protein  YP_001540481  unclonable  0.0000000000124535  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0652  CDS  NC_009954  687614  689074  -  1461  glycoside hydrolase family protein  YP_001540482  unclonable  0.000000000739457  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0710  CDS  NC_009954  744748  746613  -  1866  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  YP_001540536  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0711  CDS  NC_009954  746623  747291  -  669  class II aldolase/adducin family protein  YP_001540537  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1197  CDS  NC_009954  1259417  1262392  +  2976  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001541014  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1261  CDS  NC_009954  1332917  1334425  -  1509  exsB protein  YP_001541078  unclonable  0.000000000401588  decreased coverage  0.000000000645045  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1342  CDS  NC_009954  1416932  1419277  +  2346  DNA polymerase Pol2  YP_001541158  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1498  CDS  NC_009954  1576970  1577842  -  873  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001541312  unclonable  0.0000000000176809  normal  1  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1511  CDS  NC_009954  1592062  1593135  +  1074  hypothetical protein  YP_001541325  unclonable  0.0000000000256098  normal  0.496169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1800  CDS  NC_009954  1876202  1877800  -  1599  glycerol kinase  YP_001541611  unclonable  0.000000000739457  normal  0.482844  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>