• Click on gene locus tag to view gene information
  • Click on a column header to sort by column

13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ping_0139  CDS  NC_008709  182140  184401  +  2262  glycoside hydrolase family 3 protein  YP_941609  unclonable  0.0000855243  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0530  CDS  NC_008709  676697  678910  +  2214  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  YP_941983  unclonable  0.000055023  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0545  CDS  NC_008709  696206  697843  +  1638  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  YP_941998  unclonable  0.00000683285  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0762  CDS  NC_008709  958537  959712  +  1176  hypothetical protein  YP_942209  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_1960  CDS  NC_008709  2383691  2384998  -  1308  hypothetical protein  YP_943328  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3013  CDS  NC_008709  3712394  3714064  -  1671  30S ribosomal protein S1  YP_944314  unclonable  0.00000348916  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3169  CDS  NC_008709  3901384  3903105  -  1722  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  YP_944456  unclonable  0.0000122164  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3259  CDS  NC_008709  4021687  4022976  -  1290  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  YP_944545  unclonable  0.00000130647  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3381  CDS  NC_008709  4176925  4178001  -  1077  recombination protein RecA  YP_944666  unclonable  0.000000385109  normal  1  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3437  CDS  NC_008709  4249454  4250638  -  1185  elongation factor Tu  YP_944720  unclonable  0.00000112361  hitchhiker  0.000128836  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3438  CDS  NC_008709  4250713  4252806  -  2094  translation elongation factor G  YP_944721  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3504  CDS  NC_008709  4332705  4334033  -  1329  preprotein translocase, SecY subunit  YP_944786  hitchhiker  0.00370905  unclonable  0.00000000664102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3523  CDS  NC_008709  4341548  4342153  -  606  50S ribosomal protein L4  YP_944805  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>