• Click on gene locus tag to view gene information
  • Click on a column header to sort by column

15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pars_0384  CDS  NC_009376  333848  334933  +  1086  ATPase  YP_001152638  unclonable  0.000000176931  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0385  CDS  NC_009376  335062  335496  +  435  hypothetical protein  YP_001152639  unclonable  0.0000000175332  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0554  CDS  NC_009376  496036  497466  +  1431  aldehyde dehydrogenase  YP_001152801  unclonable  0.000000239131  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0971  CDS  NC_009376  862433  863722  +  1290  argininosuccinate lyase  YP_001153203  normal  0.0231153  unclonable  0.000000000000187264  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0972  CDS  NC_009376  863684  863995  -  312  hypothetical protein  YP_001153204  decreased coverage  0.00254861  unclonable  0.0000000000000938099  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0973  CDS  NC_009376  863976  864503  -  528  hypothetical protein  YP_001153205  decreased coverage  0.00177478  unclonable  0.000000000000129242  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0974  CDS  NC_009376  864625  865611  +  987  ABC transporter related  YP_001153206  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1567  CDS  NC_009376  1418789  1419631  -  843  CBS domain-containing protein  YP_001153773  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1568  CDS  NC_009376  1419679  1420245  -  567  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_001153774  normal  1  unclonable  0.0000000000000111249  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1569  CDS  NC_009376  1420246  1420977  -  732  glutaredoxin-like domain-containing protein  YP_001153775  normal  1  unclonable  0.0000000000000134585  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1570  CDS  NC_009376  1421006  1421386  -  381  hypothetical protein  YP_001153776  normal  1  unclonable  0.00000000000000928849  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1571  CDS  NC_009376  1421413  1422342  -  930  malate dehydrogenase  YP_001153777  normal  1  unclonable  0.0000000000000156495  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1572  CDS  NC_009376  1422411  1423757  -  1347  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001153778  normal  1  unclonable  0.0000000000000195086  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_2328  CDS  NC_009376  2084262  2084630  +  369  50S ribosomal protein L18e  YP_001154524  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_2329  CDS  NC_009376  2084627  2085187  +  561  50S ribosomal protein L13P  YP_001154525  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>