• Click on gene locus tag to view gene information
  • Click on a column header to sort by column

17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Psyr_0762  CDS  NC_007005  867577  868851  -  1275  extracellular solute-binding protein  YP_233858  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_0840  CDS  NC_007005  951821  952165  -  345  pentapeptide repeat-containing protein  YP_233936  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_1406  CDS  NC_007005  1592180  1593955  +  1776  aspartyl-tRNA synthetase  YP_234495  unclonable  0.0000271682  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_1595  CDS  NC_007005  1794461  1794913  +  453  hypothetical protein  YP_234681  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_2097  CDS  NC_007005  2444715  2445749  +  1035  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  YP_235178  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_2148  CDS  NC_007005  2505150  2505851  -  702  deoxyribonuclease I  YP_235229  unclonable  0.0000000104352  normal  0.178715  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3022  CDS  NC_007005  3619950  3620417  +  468  regulatory proteins, AsnC/Lrp  YP_236094  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3157  CDS  NC_007005  3783012  3784595  +  1584  aldehyde dehydrogenase  YP_236227  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3410  CDS  NC_007005  4073399  4076032  +  2634  hypothetical protein  YP_236480  unclonable  0.00835296  normal  0.27975  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3626  CDS  NC_007005  4309580  4310053  +  474  regulatory protein, MarR  YP_236696  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3627  CDS  NC_007005  4310244  4310663  +  420  OsmC-like protein  YP_236697  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_4187  CDS  NC_007005  4979980  4981884  -  1905  peptidase M41, FtsH  YP_237255  unclonable  0.000128423  normal  0.66671  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_4561  CDS  NC_007005  5419660  5420028  -  369  preprotein translocase subunit SecE  YP_237629  unclonable  0.00000000432419  normal  0.440887  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_4581  CDS  NC_007005  5443049  5443648  -  600  anthranilate synthase component II  YP_237649  unclonable  0.0000000148168  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_5056  CDS  NC_007005  5998600  6000162  -  1563  regulatory protein, GntR  YP_238121  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_RNA66  tRNA  NC_007005  5420075  5420150  -  76  tRNA-Trp    unclonable  0.000000000464617  normal  0.636582  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_RNA9  tRNA  NC_007005  835185  835260  +  76  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000314512  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>