293 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCAH187_A0015  CDS  NC_011658  17043  18359  1317  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  YP_002336132  unclonable  1.09924e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0016  CDS  NC_011658  18521  19408  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_002336133  unclonable  3.59602e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0017  CDS  NC_011658  19427  20017  591  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_002336134  unclonable  1.49279e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0070  CDS  NC_011658  63805  64287  483  hypothetical protein  YP_002336179  unclonable  1.37683e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0124  CDS  NC_011658  108749  109405  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002336213  unclonable  1.24346e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0125  CDS  NC_011658  109716  109895  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_002336214  unclonable  3.32702e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0126  CDS  NC_011658  110027  110560  534  transcription antitermination protein NusG  YP_002336215  unclonable  8.63076e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0127  CDS  NC_011658  110728  111153  426  50S ribosomal protein L11  YP_002336216  unclonable  6.22779e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0128  CDS  NC_011658  111331  112023  693  50S ribosomal protein L1  YP_002336217  unclonable  1.43327e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0130  CDS  NC_011658  112256  112756  501  50S ribosomal protein L10  YP_002336218  unclonable  1.24346e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0135  CDS  NC_011658  121448  121696  249  hypothetical protein  YP_002336223  unclonable  6.55713e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0138  CDS  NC_011658  122942  125020  2079  elongation factor G  YP_002336226  unclonable  5.90247e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0139  CDS  NC_011658  125138  126325  1188  elongation factor Tu  YP_002336227  unclonable  3.28194e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0140  CDS  NC_011658  126726  127034  309  30S ribosomal protein S10  YP_002336228  unclonable  3.06915e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0141  CDS  NC_011658  127069  127701  633  50S ribosomal protein L3  YP_002336229  unclonable  5.51418e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0142  CDS  NC_011658  127727  128350  624  50S ribosomal protein L4  YP_002336230  unclonable  6.90155e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0143  CDS  NC_011658  128350  128640  291  50S ribosomal protein L23  YP_002336231  unclonable  2.63853e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0144  CDS  NC_011658  128669  129499  831  50S ribosomal protein L2  YP_002336232  unclonable  1.00516e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0145  CDS  NC_011658  129560  129838  279  30S ribosomal protein S19  YP_002336233  unclonable  2.9175e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0146  CDS  NC_011658  129856  130197  342  50S ribosomal protein L22  YP_002336234  unclonable  3.64158e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0147  CDS  NC_011658  130201  130860  660  30S ribosomal protein S3  YP_002336235  unclonable  8.4584e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0163  CDS  NC_011658  137947  138657  711  methionine aminopeptidase  YP_002336251  unclonable  1.61795e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0164  CDS  NC_011658  138726  138944  219  translation initiation factor IF-1  YP_002336252  unclonable  4.8346e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0165  CDS  NC_011658  138980  139093  114  50S ribosomal protein L36  YP_002336253  unclonable  4.1135e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0166  CDS  NC_011658  139115  139480  366  30S ribosomal protein S13  YP_002336254  unclonable  8.72047e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0167  CDS  NC_011658  139505  139894  390  30S ribosomal protein S11  YP_002336255  unclonable  8.03352e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0173  CDS  NC_011658  144002  144760  759  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002336261  unclonable  1.75513e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0175  CDS  NC_011658  144913  145350  438  50S ribosomal protein L13  YP_002336262  unclonable  5.80183e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0293  tRNA  NC_011658  253839  253915  77  tRNA-Glu    unclonable  2.58541e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0294  tRNA  NC_011658  253919  253994  76  tRNA-Val    unclonable  2.61183e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0295  tRNA  NC_011658  254040  254117  78  tRNA-Asp    unclonable  2.94732e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0296  tRNA  NC_011658  254204  254278  75  tRNA-Gln    unclonable  2.66549e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0297  tRNA  NC_011658  254284  254359  76  tRNA-Lys    unclonable  2.94732e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0315  CDS  NC_011658  265996  266745  750  CAAX amino terminal protease family protein  YP_002336368  unclonable  1.81046e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0316  CDS  NC_011658  267147  267431  285  co-chaperonin GroES  YP_002336369  unclonable  4.03137e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0471  CDS  NC_011658  441092  442729  1638  PTS system, IIBC component  YP_002336498  unclonable  2.76266e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0578  CDS  NC_011658  547417  548514  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_002336603  unclonable  6.08246e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0596  rRNA  NC_011658  566747  569655  2909  23S ribosomal RNA    unclonable  4.24077e-07  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0599  rRNA  NC_011658  569756  569871  116  5S ribosomal RNA    unclonable  3.7531e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0600  tRNA  NC_011658  569879  569955  77  tRNA-Asn    unclonable  3.79275e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0601  tRNA  NC_011658  569956  570049  94  tRNA-Ser    unclonable  3.9109e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0683  CDS  NC_011658  628264  629814  1551  glycine betaine transporter  YP_002336686  unclonable  1.13352e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0739  CDS  NC_011658  690539  692158  1620  L-lactate permease  YP_002336742  unclonable  1.28008e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0804  CDS  NC_011658  761258  762109  852  phospholipase C  YP_002336807  unclonable  5.54633e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0854  tRNA  NC_011658  815083  815166  84  tRNA-Tyr    unclonable  5.40408e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0855  tRNA  NC_011658  815178  815252  75  tRNA-Gln    unclonable  4.88484e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0856  tRNA  NC_011658  815257  815332  76  tRNA-Lys    unclonable  4.73646e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0857  tRNA  NC_011658  815346  815431  86  tRNA-Leu    unclonable  4.93478e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0858  tRNA  NC_011658  815457  815531  75  tRNA-Gly    unclonable  4.73646e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0859  tRNA  NC_011658  815547  815637  91  tRNA-Leu    unclonable  4.93478e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0860  tRNA  NC_011658  815639  815717  79  tRNA-Arg    unclonable  4.6411e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0873  CDS  NC_011658  817657  818808  1152  hypothetical protein  YP_002336852  unclonable  6.08246e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0874  CDS  NC_011658  818863  819018  156  hypothetical protein  YP_002336853  unclonable  6.69301e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0875  CDS  NC_011658  819033  819239  207  hypothetical protein  YP_002336854  unclonable  7.55923e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0876  CDS  NC_011658  819377  820537  1161  peptidase, M23/M37 family  YP_002336855  unclonable  1.05464e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0935  CDS  NC_011658  872915  874579  1665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  YP_002336909  unclonable  2.03969e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0936  CDS  NC_011658  874765  875028  264  hypothetical protein  YP_002336910  unclonable  3.87132e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0937  CDS  NC_011658  875117  875677  561  rhodanese domain protein  YP_002336911  unclonable  7.26035e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0938  CDS  NC_011658  875716  876846  1131  metallo-beta-lactamase family protein  YP_002336912  unclonable  3.31666e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0939  CDS  NC_011658  876885  877112  228  hypothetical protein  YP_002336913  unclonable  2.69274e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0948  CDS  NC_011658  882982  884637  1656  Na/Pi-cotransporter family protein  YP_002336922  unclonable  1.88119e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0949  CDS  NC_011658  884803  884925  123  hypothetical protein  YP_002336923  unclonable  3.26004e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0966  CDS  NC_011658  901232  902548  1317  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_002336940  unclonable  6.2732e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0967  CDS  NC_011658  902767  903336  570  cotJC protein  YP_002336941  unclonable  8.89969e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0968  CDS  NC_011658  903349  903612  264  cotJB protein  YP_002336942  unclonable  3.7531e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0969  CDS  NC_011658  903621  903836  216  cotJA protein  YP_002336943  unclonable  3.10052e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0970  CDS  NC_011658  903937  904290  354  hypothetical protein  YP_002336944  unclonable  4.78568e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0971  CDS  NC_011658  904305  905084  780  hypothetical protein  YP_002336945  unclonable  1.84767e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0972  CDS  NC_011658  905102  905914  813  Ku protein  YP_002336946  unclonable  2.23662e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0974  CDS  NC_011658  906255  906536  282  hypothetical protein  YP_002336947  unclonable  8.36995e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0995  CDS  NC_011658  924544  924999  456  acetyltransferase  YP_002336968  unclonable  1.00516e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0996  CDS  NC_011658  925353  925697  345  putative sugE protein  YP_002336969  unclonable  6.83055e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A0997  CDS  NC_011658  925700  926014  315  putative sugE protein  YP_002336970  unclonable  5.1913e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1042  CDS  NC_011658  969719  970855  1137  hypothetical protein  YP_002337013  unclonable  1.15662e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1059  CDS  NC_011658  990917  991288  372  hypothetical protein  YP_002337029  unclonable  2.19196e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1060  CDS  NC_011658  991390  992271  882  hypothetical protein  YP_002337030  unclonable  8.77189e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1061  CDS  NC_011658  992286  994652  2367  preprotein translocase subunit SecA  YP_002337031  unclonable  3.83291e-07  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1062  CDS  NC_011658  994935  996455  1521  polysaccharide synthase family protein  YP_002337032  unclonable  2.39702e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1079  CDS  NC_011658  1016747  1018336  1590  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_002337049  unclonable  3.34554e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1103  CDS  NC_011658  1045895  1047202  1308  hypothetical protein  YP_002337073  unclonable  1.33351e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1144  CDS  NC_011658  1077401  1079137  1737  S-layer protein  YP_002337114  unclonable  3.85936e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1192  CDS  NC_011658  1118364  1118558  195  dna-binding protein  YP_002337162  unclonable  5.92004e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1193  CDS  NC_011658  1118624  1119184  561  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  YP_002337163  unclonable  1.79213e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1194  CDS  NC_011658  1119413  1120234  822  glycerol uptake facilitator protein  YP_002337164  unclonable  4.35303e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1195  CDS  NC_011658  1120248  1121738  1491  glycerol kinase  YP_002337165  unclonable  3.55688e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1288  CDS  NC_011658  1210531  1211322  792  trifolitoxin immunity domain protein  YP_002337258  unclonable  2.14818e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1314  CDS  NC_011658  1236306  1237601  1296  alpha-amylase family protein  YP_002337284  unclonable  1.03321e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1437  CDS  NC_011658  1345536  1347923  2388  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  YP_002337406  unclonable  8.66869e-08  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1506  CDS  NC_011658  1408737  1408931  195  hypothetical protein  YP_002337473  unclonable  5.03702e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1592  CDS  NC_011658  1476682  1477953  1272  peptidase, M23/M37 family  YP_002337556  unclonable  6.20859e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1593  CDS  NC_011658  1478448  1479719  1272  proton/glutamate symporter family protein  YP_002337557  unclonable  4.81335e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1594  CDS  NC_011658  1479786  1480304  519  hypothetical protein  YP_002337558  unclonable  8.28525e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1596  CDS  NC_011658  1480625  1481941  1317  Na+/H+ antiporter family protein  YP_002337559  unclonable  5.72024e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1601  CDS  NC_011658  1485133  1485765  633  DNA-binding response regulator  YP_002337564  unclonable  1.36266e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1602  CDS  NC_011658  1485896  1486159  264  hypothetical protein  YP_002337565  unclonable  4.36861e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1605  CDS  NC_011658  1488372  1489148  777  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  YP_002337568  unclonable  1.58565e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1606  CDS  NC_011658  1489257  1490108  852  ribosomal protein L5 domain protein  YP_002337569  unclonable  2.6566e-09  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1640  CDS  NC_011658  1525167  1525781  615  peptidase, M23/M37 family  YP_002337603  unclonable  6.76143e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1641  CDS  NC_011658  1525811  1526497  687  hypothetical protein  YP_002337604  unclonable  6.48968e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH187_A1643  CDS  NC_011658  1527044  1527622  579  hypothetical protein  YP_002337605  unclonable  9.17387e-10  n/a    Bacillus cereus AH187  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>