40 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
COXBURSA331_A0151  CDS  NC_010117  129455  130207  753  hypothetical protein  YP_001596038  unclonable  3.07608e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0229  CDS  NC_010117  199483  200715  1233  cell division protein FtsA  YP_001596108  unclonable  5.72026e-16  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0230  CDS  NC_010117  200737  201897  1161  cell division protein FtsZ  YP_001596109  unclonable  2.97821e-16  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0274  CDS  NC_010117  240902  241093  192  hypothetical protein  YP_001596142  unclonable  4.05541e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0275  rRNA  NC_010117  239563  241019  1457  16S ribosomal RNA    unclonable  3.73159e-15  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0276  tRNA  NC_010117  241208  241284  77  tRNA-Ile    unclonable  2.66107e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0277  tRNA  NC_010117  241289  241364  76  tRNA-Ala    unclonable  2.53017e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0278  rRNA  NC_010117  241561  245905  4345  23S ribosomal RNA segment    unclonable  8.10998e-10  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0332  CDS  NC_010117  295585  295959  375  30S ribosomal protein S12  YP_001596180  unclonable  2.75443e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0333  CDS  NC_010117  295972  296547  576  30S ribosomal protein S7  YP_001596181  unclonable  5.07835e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0334  CDS  NC_010117  296557  298656  2100  elongation factor G  YP_001596182  unclonable  6.03691e-14  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0359  CDS  NC_010117  310898  311257  360  30S ribosomal protein S13  YP_001596207  unclonable  2.16479e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0369  CDS  NC_010117  316431  317651  1221  trans-2-enoyl-CoA reductase  YP_001596217  unclonable  1.39547e-15  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0370  CDS  NC_010117  317663  318139  477  single-stranded DNA-binding protein  YP_001596218  unclonable  4.28253e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0413  CDS  NC_010117  350164  350859  696  outer membrane protein  YP_001596256  unclonable  7.43921e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0418  CDS  NC_010117  353441  354199  759  hypothetical protein  YP_001596261  unclonable  9.95525e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0496  CDS  NC_010117  422805  423152  348  50S ribosomal protein L21  YP_001596327  unclonable  3.70473e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0549  CDS  NC_010117  466460  466807  348  50S ribosomal protein L19  YP_001596372  unclonable  8.95937e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0550  CDS  NC_010117  466804  467544  741  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001596373  unclonable  6.33083e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0551  CDS  NC_010117  467546  468052  507  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001596374  unclonable  2.44188e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0565  CDS  NC_010117  477804  478157  354  putative DNA-binding protein  YP_001596387  unclonable  2.24309e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0605  CDS  NC_010117  514327  514581  255  acyl carrier protein  YP_001596426  unclonable  9.32913e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0701  CDS  NC_010117  617085  617408  324  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  YP_001596515  unclonable  3.62977e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0724  CDS  NC_010117  636112  638523  2412  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  YP_001596536  unclonable  2.38666e-13  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0725  CDS  NC_010117  638601  639098  498  putative outer membrane chaperone protein Skp  YP_001596537  unclonable  1.10627e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0749    NC_010117  664037  665134  1098      unclonable  1.98922e-16  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0849  CDS  NC_010117  759251  759520  270  hypothetical protein  YP_001596647  unclonable  1.99747e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A0885  CDS  NC_010117  790627  790839  213  carbon storage regulator  YP_001596679  unclonable  1.48731e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1291  CDS  NC_010117  1165144  1167012  1869  protein-export membrane protein SecD  YP_001597015  unclonable  6.35694e-15  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1292  CDS  NC_010117  1167028  1167378  351  preprotein translocase, YajC subunit  YP_001597016  unclonable  5.00527e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1307  CDS  NC_010117  1185526  1186227  702  putative lipoprotein  YP_001597027  unclonable  3.46981e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1332  CDS  NC_010117  1207616  1207939  324  RNA-binding protein  YP_001597044  unclonable  5.53412e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1369  CDS  NC_010117  1245733  1245930  198  putative lipoprotein  YP_001597076  unclonable  2.11152e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1370  CDS  NC_010117  1246041  1246922  882  haloalkane dehalogenase  YP_001597077  unclonable  6.59212e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1585  CDS  NC_010117  1450796  1451248  453  surface antigen  YP_001597263  unclonable  1.82474e-17  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1641  CDS  NC_010117  1499056  1499340  285  DNA-binding protein HU  YP_001597305  unclonable  7.02248e-19  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1751  CDS  NC_010117  1599621  1601393  1773  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001597402  unclonable  1.2582e-14  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A1941  CDS  NC_010117  1770233  1770661  429  50S ribosomal protein L13  YP_001597570  unclonable  7.62792e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A2179  CDS  NC_010117  1983090  1983212  123  hypothetical protein  YP_001597789  unclonable  5.70518e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
COXBURSA331_A2230  CDS  NC_010117  242743  243129  387  hypothetical protein  YP_001596143  unclonable  7.8637e-18  n/a    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>