More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ile-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  94.52 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0049  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.319822 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0056  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4324  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0058  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.784686  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  94.52 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  94.52 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  94.52 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  94.52 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  98.28 
 
 
74 bp  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.36136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.53567e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  8.46583e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  1.68156e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1916  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  8.28574e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0276  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.66107e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0047  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0030  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0041  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.339834  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0064  tRNA-Ile  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0058  tRNA-Ile  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0052  tRNA-Ile  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.6688e-08  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.266e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.49492e-05  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna57  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000350129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  6.96824e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  90.91 
 
 
80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  90.91 
 
 
80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna50  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000949027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  98.11 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  8.36991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  98.11 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  2.26616e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.4398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0083  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  2.77539e-05  normal  0.33634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.26175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.89104e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.39545e-08  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0088  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.56507e-06  normal  0.184684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.29393e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0009  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102248  normal  0.0119324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0004  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  7.67494e-06  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.15074e-06  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0050  tRNA-Ile  95 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000598059  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0014  tRNA-Ile  95 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0184552  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>