14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0020 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0020  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4833  hypothetical protein  43.8 
 
 
248 aa  107  7e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0216  hypothetical protein  44.76 
 
 
130 aa  75.5  3e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2890  hypothetical protein  44.76 
 
 
116 aa  75.5  3e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6961  hypothetical protein  42.45 
 
 
108 aa  72.8  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3507  hypothetical protein  39.78 
 
 
109 aa  68.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.446944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0247  hypothetical protein  33.65 
 
 
119 aa  68.9  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4581  hypothetical protein  39.78 
 
 
109 aa  68.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4591  hypothetical protein  39.18 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5463  hypothetical protein  48.44 
 
 
73 aa  62.8  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5920  hypothetical protein  38.61 
 
 
108 aa  58.9  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.049411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0019  hypothetical protein  35.23 
 
 
205 aa  57.4  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3868  hypothetical protein  35.48 
 
 
121 aa  56.6  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5462  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>