13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5920 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5920  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  224  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.049411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0247  hypothetical protein  41.84 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2890  hypothetical protein  43.69 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0216  hypothetical protein  43.69 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6961  hypothetical protein  41.84 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3868  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4833  hypothetical protein  32.08 
 
 
248 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0020  hypothetical protein  38.61 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0019  hypothetical protein  34 
 
 
205 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4591  hypothetical protein  35.11 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4581  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3507  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.446944  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5463  hypothetical protein  42.42 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>