62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1805 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  85.09 
 
 
114 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  71.05 
 
 
129 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  69.16 
 
 
116 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  68.22 
 
 
214 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  64.81 
 
 
169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  71.43 
 
 
127 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  64.55 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  62.73 
 
 
113 aa  140  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  62.73 
 
 
113 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  57.02 
 
 
114 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  62.28 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  53.91 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  59.13 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  57.94 
 
 
116 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  63.04 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  51.85 
 
 
128 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  60.87 
 
 
114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  54.13 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  58.41 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  58.7 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  54.13 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  52.08 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  60.36 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  59.46 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  57.52 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  57.52 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  58.56 
 
 
111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  57.52 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  58.7 
 
 
115 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  57.27 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  49.14 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  49.14 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  54.95 
 
 
119 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  54.12 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  41.07 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  41.28 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  39.05 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  39.62 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  40.57 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  38.68 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  36.79 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  40.74 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  38.68 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  44.71 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  39.64 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  43.12 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  36.19 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  35.51 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  41.76 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  38 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  35.71 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  40.7 
 
 
98 aa  66.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  40.37 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  40.7 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  34.82 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  40.19 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  33.93 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  39.44 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>