15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1486 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0511385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0386  hypothetical protein  59.2 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0788  50S ribosomal protein L23  50.39 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1470  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.42 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15080  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.48 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1205  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / pyrimidine dimer DNA glycosylase  52 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0704  hypothetical protein  48.39 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2927  pyrimidine dimer DNA glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.96 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3486  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1958  hypothetical protein  45.24 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0746675  hitchhiker  0.00408107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2949  hypothetical protein  48.39 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.134771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11900  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.48 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.97418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00360  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.62 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0336  hypothetical protein  36.73 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.072829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>