26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1638 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1638  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0725  hypothetical protein  74.91 
 
 
294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07741  hypothetical protein  65.26 
 
 
299 aa  344  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.311592 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05321  hypothetical protein  54.26 
 
 
295 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.440556  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05851  hypothetical protein  52.82 
 
 
295 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.450432  normal  0.960414 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1860  hypothetical protein  52.82 
 
 
295 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0995872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05851  hypothetical protein  47.74 
 
 
301 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05551  hypothetical protein  46.53 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0529  hypothetical protein  45.99 
 
 
301 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.784322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05931  hypothetical protein  44.95 
 
 
301 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2159  hypothetical protein  36.43 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1936  hypothetical protein  36.18 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1590  hypothetical protein  37.41 
 
 
285 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.846445  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4383  protein of unknown function DUF1092  36.49 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4445  protein of unknown function DUF1092  36.49 
 
 
293 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.414391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0060  protein of unknown function DUF1092  33.67 
 
 
290 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4728  hypothetical protein  34.27 
 
 
286 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0781  protein of unknown function DUF1092  36.81 
 
 
288 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88180  psaB translation factor  32.08 
 
 
379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363654  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11792  predicted protein  32.53 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3687  hypothetical protein  31.34 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0136  hypothetical protein  29.51 
 
 
264 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000036691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1387  protein of unknown function DUF1092  28.28 
 
 
271 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4636  hypothetical protein  25.26 
 
 
265 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.190902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4079  protein of unknown function DUF1092  23.45 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4118  protein of unknown function DUF1092  22.41 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>