26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1387 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1387  protein of unknown function DUF1092  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4079  protein of unknown function DUF1092  61.25 
 
 
273 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4118  protein of unknown function DUF1092  61.25 
 
 
273 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0136  hypothetical protein  54.68 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000036691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4636  hypothetical protein  54.81 
 
 
265 aa  296  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.190902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3687  hypothetical protein  52.67 
 
 
283 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1936  hypothetical protein  30.54 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2159  hypothetical protein  30.85 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88180  psaB translation factor  31.16 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0781  protein of unknown function DUF1092  29.17 
 
 
288 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4728  hypothetical protein  30.1 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05851  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.450432  normal  0.960414 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1860  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0995872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1590  hypothetical protein  29.97 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.846445  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05321  hypothetical protein  27.49 
 
 
295 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.440556  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0060  protein of unknown function DUF1092  27.42 
 
 
290 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07741  hypothetical protein  27.99 
 
 
299 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.311592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1638  hypothetical protein  27.59 
 
 
293 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4383  protein of unknown function DUF1092  26.95 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4445  protein of unknown function DUF1092  27.21 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.414391 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05851  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0529  hypothetical protein  24.05 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.784322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05551  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11792  predicted protein  28.87 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733277  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05931  hypothetical protein  23.97 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0725  hypothetical protein  27.24 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>