20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2262 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2262  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  597  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.473761  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0418  hypothetical protein  69.1 
 
 
340 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03191  hypothetical protein  59.53 
 
 
326 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.997762 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00711  hypothetical protein  55.49 
 
 
328 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01271  hypothetical protein  55.79 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029164  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1426  hypothetical protein  54.88 
 
 
320 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00751  hypothetical protein  51.71 
 
 
309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00721  hypothetical protein  49.53 
 
 
308 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0065  hypothetical protein  49.52 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00741  hypothetical protein  48.5 
 
 
309 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2015  hypothetical protein  60.33 
 
 
277 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.355614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4014  Ycf66 family protein  75 
 
 
319 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2650  Ycf66 family protein  71.57 
 
 
299 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.093415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3467  Ycf66 family protein  71.57 
 
 
299 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0519  Ycf66-like  65.38 
 
 
301 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0370943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1483  Ycf66 family protein  64.76 
 
 
279 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0055  Ycf66 family protein  39.29 
 
 
306 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3709  hypothetical protein  43.13 
 
 
295 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9568  predicted protein  50.72 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  23.46 
 
 
985 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>