34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3294 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  83.72 
 
 
215 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  71.63 
 
 
216 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  75.37 
 
 
212 aa  329  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  70.14 
 
 
212 aa  322  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  70.14 
 
 
215 aa  321  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  71.09 
 
 
212 aa  320  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  69.67 
 
 
215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  69.67 
 
 
215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  69.67 
 
 
215 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  70.62 
 
 
212 aa  316  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  69.67 
 
 
212 aa  315  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  72.41 
 
 
212 aa  315  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  68.29 
 
 
209 aa  304  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  64.45 
 
 
212 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  65.87 
 
 
213 aa  294  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  42.33 
 
 
223 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  44.39 
 
 
214 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  40.38 
 
 
215 aa  177  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
216 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  30.48 
 
 
225 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  29.95 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  31.41 
 
 
223 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
214 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  30.37 
 
 
223 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  29.63 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  30.57 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>