More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2043 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  100 
 
 
77 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.9502e-09  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  7.7006e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.08066e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.55434e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.88634e-07  unclonable  8.90491e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  97.4 
 
 
77 aa  146  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.8664e-09  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.38911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.15668e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.02043e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  6.56295e-11  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.79854e-07  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.66609e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  96.1 
 
 
77 aa  145  1e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.14435e-09  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  94.81 
 
 
77 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.85272e-08  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  88.31 
 
 
79 aa  133  6e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  8.62864e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  132  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  132  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.03689e-10  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  132  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.99329e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  87.01 
 
 
77 aa  131  4e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  87.01 
 
 
77 aa  131  4e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.14141e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  86.84 
 
 
77 aa  130  7e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  6.39035e-09  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  130  8e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  85.71 
 
 
77 aa  130  8e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  130  8e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  8.75833e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  85.53 
 
 
110 aa  129  1e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  129  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  7.29948e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  84.42 
 
 
78 aa  129  2e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.12562e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  4e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  84.21 
 
 
77 aa  127  4e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  81.58 
 
 
79 aa  127  5e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.23844e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  8.39248e-10  hitchhiker  2.62365e-15 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.03813e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  4.01427e-06  hitchhiker  2.02194e-13 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.74294e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  3.83773e-07  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.96587e-08  hitchhiker  1.69384e-07 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.56136e-06  decreased coverage  3.55808e-20 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23338e-10  hitchhiker  2.56014e-06 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.74722e-05  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.26358e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.44532e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  127  8e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.66866e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  81.82 
 
 
78 aa  126  9e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.56515e-11  hitchhiker  5.41151e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  80.26 
 
 
79 aa  126  1e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  82.89 
 
 
79 aa  126  1e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  81.58 
 
 
79 aa  126  1e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  84 
 
 
76 aa  125  1e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.22767e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  81.82 
 
 
78 aa  125  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  81.58 
 
 
78 aa  125  2e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.23369e-14  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  125  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  2.16154e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  83.12 
 
 
78 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  81.82 
 
 
78 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  80.26 
 
 
79 aa  124  4e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  81.58 
 
 
79 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  1.52652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  80.26 
 
 
80 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  77.63 
 
 
82 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  77.63 
 
 
82 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  80.52 
 
 
78 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  80.26 
 
 
78 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  79.22 
 
 
78 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  79.22 
 
 
78 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.26432e-05  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  78.95 
 
 
78 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  80.26 
 
 
78 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  76.32 
 
 
84 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.32913e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  76.62 
 
 
79 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  75 
 
 
84 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.05484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  76.62 
 
 
77 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0433  acyl carrier protein  79.22 
 
 
77 aa  120  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.145071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  76.32 
 
 
79 aa  119  2e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  117  4e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  75 
 
 
82 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  75 
 
 
82 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  76.71 
 
 
77 aa  115  2e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  115  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  78.08 
 
 
78 aa  114  4e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.1745e-15  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>