34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36030  Ykud domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0509  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.59 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8227  hypothetical protein  42.79 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.74 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.81 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.94 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4333  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.83 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.11 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8763  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4659  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.83 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0138559  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.88 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0812  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.96 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2688  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.34 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00428161  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.17 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.38 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644792  decreased coverage  0.00106485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5686  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.2 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4259  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.92 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098487  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0678  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.92298  normal  0.301667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.11 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0772  hypothetical protein  23.23 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.8508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.19 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.86 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.48 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421702  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.48 
 
 		 332 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.81 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>