27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17510  phosphopantetheine-containing protein  100 
 
 
84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  33.78 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  33.78 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 
2103 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  31.51 
 
 
5021 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  31.51 
 
 
4874 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  31.51 
 
 
5023 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  27.5 
 
 
1656 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  30.14 
 
 
3818 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
2477 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  28 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  35.44 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  28 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 
1474 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.33 
 
 
2890 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  41.38 
 
 
2547 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  27.71 
 
 
101 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  29.58 
 
 
3925 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  31.08 
 
 
5628 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  30.43 
 
 
5822 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  30.43 
 
 
4212 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  30.43 
 
 
5993 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  30.43 
 
 
5915 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  30.43 
 
 
5778 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  30.99 
 
 
4036 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 
1835 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  26.74 
 
 
2363 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>