10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0109 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0050  hypothetical protein  56 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0074  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0061  hypothetical protein  54 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0055  hypothetical protein  52 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00310  hypothetical protein  52 
 
 		 53 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.909556  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2382  hypothetical protein  52 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0018  hypothetical protein  52 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0017  hypothetical protein  52 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0375  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>