277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_R0049 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.46842e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.14669e-08  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.99431e-08  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.34137e-07  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.04416e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.00655e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.82933e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.35445e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.90046e-07  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.73261e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0055  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.33833e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0073  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.50296e-10  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.53794e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0098  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.47145e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.04325e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.53744e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.85939e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.05665e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.05665e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0091  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.08564e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0092  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.5215e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0095  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.80778e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0096  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.83428e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0097  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.67746e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.07687e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.13258e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.03697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.73175e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.74224e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0090  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.21304e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t050  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t051  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.57553e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t052  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0052  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.6845e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.02168e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.96126e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t080  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  149  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.27089e-11  normal  0.640571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  149  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.29685e-11  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t078  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  149  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.16126e-11  normal  0.643909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t082  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  149  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.11549e-11  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t079  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  149  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.10415e-11  normal  0.651496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0075  tRNA-Asn  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.18117e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0077  tRNA-Asn  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.20166e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0076  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.9522e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0074  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.06993e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0081  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.66422e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.54506e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.53909e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.90544e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0080  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.120667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0070  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.11799e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0068  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.31868e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.95579e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0073  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.91565e-05  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0076  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.73858e-06  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0077  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.73858e-06  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0078  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.54135e-06  normal  0.120054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0079  tRNA-Asn  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.64288e-05  normal  0.119023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0045  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.79772e-09  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4240  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.48867e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0044  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000371151  hitchhiker  0.00258348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0026  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0025  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.253153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0024  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.131975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2105  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  6.27043e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1689  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  3.9429e-11  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4235  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0055  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0046  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.33647e-08  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0056  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.59002e-06  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0074  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.84221e-06  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1147  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.75787e-11  hitchhiker  1.60242e-14 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1140  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.9643e-10  hitchhiker  1.18224e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1138  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.3435e-10  hitchhiker  3.16905e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0877  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.09556e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1135  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.55907e-09  hitchhiker  5.76998e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0701  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.00783e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0047  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044997  normal  0.297586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0768  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.85635e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1678  tRNA-Asn  97.22 
 
 
78 bp  127  4e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  7.5386e-11  normal  0.180154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.44921e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5044  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.06715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.6805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0067  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.057405  normal  0.869795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0070  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>