27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4700 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 65 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  68.75 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  68.75 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  68.75 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  69.81 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  69.81 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  52.73 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  39.68 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  55 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  55 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  48.78 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  51.22 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  36.36 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  42.22 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  55 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>