More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4067 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  71.34 
 
 
494 aa  685  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  100 
 
 
502 aa  998  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  66.19 
 
 
496 aa  639  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  66.19 
 
 
496 aa  640  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  64.95 
 
 
496 aa  639  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  66.67 
 
 
495 aa  638  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  67.42 
 
 
496 aa  660  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  65.77 
 
 
496 aa  643  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  68.54 
 
 
492 aa  668  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  65.36 
 
 
496 aa  652  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  68.45 
 
 
496 aa  679  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  65.49 
 
 
502 aa  643  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  68.6 
 
 
494 aa  642  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  66.94 
 
 
496 aa  650  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  68.54 
 
 
492 aa  668  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  77.71 
 
 
493 aa  711  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  67.09 
 
 
496 aa  660  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  67.28 
 
 
501 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  65.3 
 
 
499 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  68.65 
 
 
492 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1226  sulphate transporter  68.04 
 
 
496 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  67.48 
 
 
501 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  68.04 
 
 
495 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  63.92 
 
 
495 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  63.09 
 
 
495 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  64.12 
 
 
495 aa  625  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1995  sulphate transporter  67.42 
 
 
496 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0186  sulphate transporter  67.42 
 
 
496 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  68.37 
 
 
498 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1049  sulphate transporter  64.95 
 
 
500 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.000191113 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  66.74 
 
 
493 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  62.15 
 
 
500 aa  620  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  63.84 
 
 
495 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0790  sulphate transporter  67.63 
 
 
496 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  68.1 
 
 
498 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  61.96 
 
 
497 aa  602  1e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  62.81 
 
 
495 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  1.46923e-13 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1911  sulphate transporter  60.94 
 
 
497 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42059  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  60.41 
 
 
499 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  61.02 
 
 
499 aa  594  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0431  sulphate transporter  61.28 
 
 
494 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3086  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  63.69 
 
 
495 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3234  sulfate permease family protein  63.9 
 
 
495 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  57.49 
 
 
496 aa  573  1e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  61.59 
 
 
499 aa  573  1e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  62.61 
 
 
484 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  57.44 
 
 
487 aa  563  1e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  57.05 
 
 
483 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2639  sulphate transporter  56.59 
 
 
502 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  54.68 
 
 
483 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  54.47 
 
 
492 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  54.47 
 
 
483 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  55.09 
 
 
483 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  55.09 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  55.09 
 
 
483 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  54.89 
 
 
483 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  55.09 
 
 
483 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  54.68 
 
 
483 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  54.68 
 
 
483 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1264  sulphate transporter  57.35 
 
 
492 aa  521  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.036153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  53.43 
 
 
514 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  53.93 
 
 
527 aa  493  1e-138  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  53.5 
 
 
499 aa  492  1e-138  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2483  sulphate transporter  55.46 
 
 
488 aa  494  1e-138  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3392  sulphate transporter  55.85 
 
 
487 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.106782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  52.65 
 
 
506 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2191  sulphate transporter  56.93 
 
 
488 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  8.78585e-05  normal  0.36183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0427  sulphate transporter  54.75 
 
 
493 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0815  sulphate transporter  54.43 
 
 
484 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3975  sulphate transporter  53.71 
 
 
526 aa  469  1e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0104  sulphate transporter  53.25 
 
 
500 aa  466  1e-130  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0913  sulphate transporter  53.73 
 
 
496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0735  sulphate transporter  53.25 
 
 
554 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725862  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1159  sulphate transporter  53.66 
 
 
500 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.778389  normal  0.502681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3487  sulphate transporter  55.15 
 
 
496 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0902  sulphate transporter  53.73 
 
 
496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  53.2 
 
 
496 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  50.31 
 
 
483 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0896  sulphate transporter  53.73 
 
 
496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3144  sulphate transporter  52.83 
 
 
501 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0555  sulphate transporter  51.55 
 
 
497 aa  446  1e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21570  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  51.23 
 
 
505 aa  440  1e-122  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04150  sulfate permease  52.07 
 
 
495 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4306  sulphate transporter  50.83 
 
 
502 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0228312  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05020  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  51.77 
 
 
520 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1810  putative sulfate transporter  46.33 
 
 
520 aa  416  1e-115  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35810  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  51.15 
 
 
531 aa  417  1e-115  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0845  putative sulfate transporter  46.69 
 
 
523 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14611  putative sulfate transporter  45.45 
 
 
514 aa  406  1e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324968  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12181  putative sulfate transporter  45.64 
 
 
526 aa  407  1e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0471  sulphate transporter  51.7 
 
 
542 aa  407  1e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0631  putative sulfate transporter  45.11 
 
 
527 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0142  sulphate transporter  50.52 
 
 
507 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07001  putative sulfate transporter  43.58 
 
 
521 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0644  putative sulfate transporter  43 
 
 
521 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06711  putative sulfate transporter  43.58 
 
 
521 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  44.44 
 
 
540 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07551  putative sulfate transporter  44.12 
 
 
525 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0159934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07101  putative sulfate transporter  43.41 
 
 
524 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  44.51 
 
 
512 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>