23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3148 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  85.96 
 
 
533 aa  823    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  100 
 
 
535 aa  1033    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  49.14 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  34.23 
 
 
519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  35.4 
 
 
533 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  31.67 
 
 
589 aa  230  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  32.73 
 
 
531 aa  224  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.27 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.58 
 
 
527 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.21 
 
 
596 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.58 
 
 
530 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.58 
 
 
530 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.65 
 
 
533 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  31.85 
 
 
526 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  28.26 
 
 
530 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  29.29 
 
 
551 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  29.1 
 
 
514 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  28.99 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  26.9 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  26.99 
 
 
444 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  23.79 
 
 
497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119535  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4306  sulphate transporter  27.54 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0228312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  28.9 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>