15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6457 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6457  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3243  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00128168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0508  hypothetical protein  37.86 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0030  hypothetical protein  39.55 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0009915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3406  hypothetical protein  33.77 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.088812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0587  hypothetical protein  37.04 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0286  hypothetical protein  34.38 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0286  hypothetical protein  34.38 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0144  hypothetical protein  34.53 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4859  hypothetical protein  36.03 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2670  hypothetical protein  34.81 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3347  hypothetical protein  33.57 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184685  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33921  predicted protein  26.62 
 
 
251 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4136  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1460  hypothetical protein  28.19 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.355787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>