31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2648 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
216 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  71.63 
 
 
215 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  71.16 
 
 
215 aa  327  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  69.42 
 
 
212 aa  317  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  72.5 
 
 
215 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  72.5 
 
 
215 aa  314  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  72.5 
 
 
215 aa  314  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  72 
 
 
215 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  69.42 
 
 
212 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  70.44 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  71.57 
 
 
212 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  71.29 
 
 
212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  69.46 
 
 
212 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  68 
 
 
209 aa  297  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  65.37 
 
 
212 aa  291  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  63.94 
 
 
213 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  43.75 
 
 
215 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  45.54 
 
 
223 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  44.66 
 
 
214 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  33.68 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
216 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  30.21 
 
 
216 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.98 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  28.06 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  27.55 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  28.88 
 
 
210 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  28.88 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>