160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2098 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.61603e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.84609e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.97862e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.36258e-09  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.74172e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.52128e-11  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  3.34703e-06  hitchhiker  4.33032e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.00662e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.63209e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.11621e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.56224e-08  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.70601e-06  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  1.32078e-10 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  149  1e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  149  1e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  95.4 
 
 
87 bp  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  95.4 
 
 
87 bp  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  117  4e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  2.37414e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  96.97 
 
 
87 bp  115  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  96.97 
 
 
84 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  96.97 
 
 
87 bp  115  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  96.97 
 
 
84 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  91.95 
 
 
86 bp  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  91.95 
 
 
86 bp  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  90.8 
 
 
86 bp  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.34529e-13  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  90.8 
 
 
86 bp  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.84706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  90.8 
 
 
86 bp  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.77082e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna121  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  99.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.62621e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  93.94 
 
 
84 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  93.94 
 
 
84 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  93.94 
 
 
84 bp  99.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu02  tRNA-Leu  92.42 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0074  tRNA-Leu  88.75 
 
 
87 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0085  tRNA-Leu  97.83 
 
 
86 bp  83.8  6e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196786  normal  0.612491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0068  tRNA-Leu  97.83 
 
 
86 bp  83.8  6e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95.83 
 
 
87 bp  79.8  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00291097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.66309e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.39453e-06  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.31173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.64513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0102  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0104  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00197165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.42441e-06  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.02831e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.43038e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0100  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00215722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.13297e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.71142e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.18641e-05  hitchhiker  1.24407e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t065  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.16736e-05  hitchhiker  8.61256e-09 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000463268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  9.96161e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.428944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t066  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.41762e-05  hitchhiker  8.76974e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t071  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.62467e-10  normal  0.0211471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.89086e-05  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.7716e-05  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0089  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.02516e-05  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.16077e-06  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.02371e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  4e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  77.8  4e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  75.8  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  75.8  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  75.8  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0004  tRNA-Leu  95.65 
 
 
87 bp  75.8  2e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000420455  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0694  tRNA-Leu  89.39 
 
 
87 bp  75.8  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.108922  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0838  tRNA-Leu  89.39 
 
 
87 bp  75.8  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.30479e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  85.06 
 
 
87 bp  69.9  9e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  9e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.00338e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  93.62 
 
 
89 bp  69.9  9e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  93.62 
 
 
89 bp  69.9  9e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  93.62 
 
 
89 bp  69.9  9e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.62 
 
 
89 bp  69.9  9e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  93.62 
 
 
86 bp  69.9  9e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  4e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.50179e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  4e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  4e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  4e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>