19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2284 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2284  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.422947  hitchhiker  4.08256e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2616  hypothetical protein  46.57 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00545088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3819  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3535  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3455  hypothetical protein  28.09 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0327  hypothetical protein  30.43 
 
 		 502 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.013226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3450  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3082  hypothetical protein  30.41 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484609  hitchhiker  0.000108823 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0645  hypothetical protein  28.46 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000041457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0583  hypothetical protein  28.46 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000169338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0830  hypothetical protein  35.37 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2214  DnaA analog, DnaD domain protein  34.04 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2681  hypothetical protein  31.68 
 
 		 567 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0867  hypothetical protein  36 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0884  phi ETA orf 22-like protein  36 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1021  hypothetical protein  29.47 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1598  hypothetical protein  40.54 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00739094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1694  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101296  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  22.9 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>