17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0112 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  54.72 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  53.57 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  53.85 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  53.57 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  63.16 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  68.52 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  65.79 
 
 		 51 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  52 
 
 		 51 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  65.79 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  80.49 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  59.65 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  82.05 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  48.15 
 
 		 53 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1658  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.222694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  82.05 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  82.05 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>