23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0132 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1163  transposase  98.13 
 
 
1176 bp  2157    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168217  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0888  transposase  98.98 
 
 
1176 bp  2236    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.261933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0883  transposase  98.64 
 
 
1176 bp  2204    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.017573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0881  transposase  98.64 
 
 
1176 bp  2204    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0367  transposase  99.74 
 
 
1176 bp  2307    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0132    100 
 
 
1176 bp  2331    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0586413  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2477  transposase  98.21 
 
 
1176 bp  2165    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2337  transposase  98.3 
 
 
1176 bp  2173    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1360  transposase  98.13 
 
 
1176 bp  2157    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000208004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1343  transposase  98.13 
 
 
1176 bp  2157    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1080  transposase  98.21 
 
 
1176 bp  2165    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.765479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1053  transposase  98.21 
 
 
1176 bp  2165    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0894608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0986  transposase  98.3 
 
 
1176 bp  2173    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0705  transposase  98.3 
 
 
1176 bp  2173    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0673  transposase  98.3 
 
 
1176 bp  2173    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0551  transposase  98.13 
 
 
1176 bp  2157    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0516  transposase  98.21 
 
 
1176 bp  2165    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0116  transposase  98.13 
 
 
1176 bp  2157    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.217246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1917    98.04 
 
 
1166 bp  2159    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0448  IS256 family transposase  77.85 
 
 
1176 bp  141  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.495192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0434    87.65 
 
 
186 bp  81.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.146007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1654  hypothetical protein  100 
 
 
111 bp  65.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11814  hypothetical protein  100 
 
 
4176 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284555  normal  0.623298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>