19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0071 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0071  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  216  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  47.83 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  38.54 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  36.61 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  45.33 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  48.53 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  34.65 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  32.04 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  44.78 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2498  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  45.16 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  43.55 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  43.55 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  40.58 
 
 
151 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  41.79 
 
 
163 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3405  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.460418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  44.9 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>