15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3948 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  96.07 
 
 		 197 aa  327  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  41.46 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  41.38 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  31.53 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  34.27 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  32.57 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  33.94 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  31.91 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.19 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  32.7 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  35.24 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>