13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1507 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  925    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000660776  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2656  hypothetical protein  82.24 
 
 		 455 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0271609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1823  hypothetical protein  48.87 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3432  hypothetical protein  45.07 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1785  hypothetical protein  46.77 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2083  hypothetical protein  45.16 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4349  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  30.95 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0595  hypothetical protein  27.03 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00485606  hitchhiker  0.00425938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0693  hypothetical protein  28.24 
 
 		 107 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0254  hypothetical protein  35.58 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00245145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>