43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0445 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0445  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  322  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000109917  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  92.54 
 
 
352 aa  265  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 
298 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 
298 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 
298 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 
298 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  32.81 
 
 
298 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  28.93 
 
 
249 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1521  hypothetical protein  29.59 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.866881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1636  hypothetical protein  29.59 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1527  hypothetical protein  29.59 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.524444 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1789  hypothetical protein  29.59 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  29.09 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  29.09 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  29.09 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  29.09 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1315  hypothetical protein  29.59 
 
 
116 aa  44.3  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  26.62 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1490  hypothetical protein  28.43 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  27.27 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4823  hypothetical protein  27.87 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  25.22 
 
 
276 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>