12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5463 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5463  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4591  hypothetical protein  55.38 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0020  hypothetical protein  48.44 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0247  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0216  hypothetical protein  48.39 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2890  hypothetical protein  48.39 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4581  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3507  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.446944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6961  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5920  hypothetical protein  42.42 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.049411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3868  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4833  hypothetical protein  40.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>