24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4149 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4149  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4150  hypothetical protein  54.82 
 
 
236 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3151  hypothetical protein  42.93 
 
 
217 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0480  hypothetical protein  50.63 
 
 
241 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0475  hypothetical protein  50.63 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0197  hypothetical protein  42.02 
 
 
212 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0057  hypothetical protein  42.56 
 
 
214 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3544  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3440  hypothetical protein  44.03 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3235  hypothetical protein  39.18 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0447  hypothetical protein  48.47 
 
 
236 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0055  hypothetical protein  44.2 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000944015 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3698  hypothetical protein  38.12 
 
 
211 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1284  hypothetical protein  38.66 
 
 
193 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.103295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3458  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2973  hypothetical protein  43.48 
 
 
196 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1621  hypothetical protein  39.44 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1837  hypothetical protein  43.59 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3678  hypothetical protein  36.02 
 
 
222 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1187  hypothetical protein  33.92 
 
 
203 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326391  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1177  hypothetical protein  35.26 
 
 
203 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1160  hypothetical protein  35.26 
 
 
203 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1500  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624694  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3987  hypothetical protein  36.69 
 
 
158 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>