66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1176 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1176  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  57.35 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2294  hypothetical protein  65.15 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  56.06 
 
 
66 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5384  hypothetical protein  76 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406208  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  61.22 
 
 
63 aa  67  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  44.93 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  53.97 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  45.59 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4499  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3136  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000286621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4504  hypothetical protein  43.28 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000229476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0697  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000971992  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4538  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4553  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4314  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0022719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4152  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.120970000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4163  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4649  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000137782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4266  hypothetical protein  44.78 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0547  hypothetical protein  57.78 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353499  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3560  hypothetical protein  66.67 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0161833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  59.57 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4440  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1650  hypothetical protein  50.98 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000012075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0155  hypothetical protein  44.62 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000254633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2070  hypothetical protein  48.84 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3356  hypothetical protein  48.53 
 
 
70 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000427569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0928  hypothetical protein  38.81 
 
 
68 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1455  hypothetical protein  44.78 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00399997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2520  hypothetical protein  38.81 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000165687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  42.19 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0305  hypothetical protein  69.39 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  44.62 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0153  hypothetical protein  41.54 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0251  hypothetical protein  62.5 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837242  hitchhiker  0.00453428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  42.65 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0521  hypothetical protein  65.62 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.557857  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1082  hypothetical protein  40.38 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0821  hypothetical protein  35.21 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0176075  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  43.86 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  41.51 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1945  hypothetical protein  35.82 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0255588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0975  hypothetical protein  56.82 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  39.62 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  37.74 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  44.68 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  37.74 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1609  hypothetical protein  46.51 
 
 
73 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  37.74 
 
 
64 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  37.74 
 
 
64 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  37.74 
 
 
64 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  39.53 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21910  hypothetical protein  44.19 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2081  hypothetical protein  77.27 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  38.78 
 
 
64 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>