16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1611 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1611  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4192  hypothetical protein  34.66 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0719579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0811  hypothetical protein  31.65 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1225  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1367  hypothetical protein  31.18 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0848  hypothetical protein  32.82 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612361  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0960  hypothetical protein  25.75 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00158317  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0792  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0229  hypothetical protein  39.45 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  31.01 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2178  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0251781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0299  hypothetical protein  32.06 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0714  hypothetical protein  32.08 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  26.12 
 
 
270 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0952  hypothetical protein  33.68 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0339  hypothetical protein  32.63 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.109845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>