58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0605 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0605  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000130603  normal  0.454931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0366  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000405379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  31.53 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  32.38 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  34.58 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  28.83 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  28.83 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0791  hypothetical protein  30.63 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.967276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  27.62 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  31.48 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  32.69 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  30.63 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  29.91 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  35.58 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  34.62 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  32.71 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
132 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  32.69 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  32.73 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  30.19 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  35.78 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05570  hypothetical protein  32.41 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.579477  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  33.65 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  31.82 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  29.91 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  28.44 
 
 
115 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  25.69 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  26.96 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  30.1 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0862  protein of unknown function DUF322  25.71 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000204946  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  27.62 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0750  hypothetical protein  32.43 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000236289  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1473  protein of unknown function DUF322  23.71 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  32.41 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  32.69 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  35.59 
 
 
128 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  29.52 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  29.9 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  38.33 
 
 
140 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  32.73 
 
 
159 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>