22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00829 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00829  lipoprotein  100 
 
 		 55 aa  103  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3646  lipoprotein  85.45 
 
 		 55 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4723  putative lipoprotein  85.45 
 
 		 55 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0732932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1706  hypothetical protein  79.59 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2357  hypothetical protein  79.59 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2318  hypothetical protein  79.59 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2237  hypothetical protein  77.55 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1246  hypothetical protein  92.5 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.657721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3300  hypothetical protein  70.18 
 
 		 70 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2086  hypothetical protein  74.47 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0958249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920.1  hypothetical protein  75.51 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1197  putative lipoprotein  87.18 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0319  hypothetical protein  87.18 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0320023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2341  hypothetical protein  91.89 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0112446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1189  putative lipoprotein  87.18 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0831  hypothetical protein  87.18 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1036  hypothetical protein  87.18 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5660  hypothetical protein  89.47 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0959  hypothetical protein  90.32 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2781  putative lipoprotein  65.12 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3583  putative lipoprotein  53.7 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0218279  hitchhiker  0.00000158085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0375  putative lipoprotein  60 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>