10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0732 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0732  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 54 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0430029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0015  Cbb3-type cytochrome oxidase component  87.04 
 
 		 54 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0018  Cbb3-type cytochrome oxidase component  74.07 
 
 		 54 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0013  Cbb3-type cytochrome oxidase component  68.52 
 
 		 54 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3661  Cbb3-type cytochrome oxidase component  48 
 
 		 50 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.678332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1530  Cbb3-type cytochrome oxidase component  64.71 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1151  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.18 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.340113  normal  0.0945912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0461  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.55 
 
 		 53 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150757  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3272  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348375  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0641  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  44.19 
 
 		 54 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000266851  normal  0.653768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>