More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0693 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0693  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 61 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1359  30S ribosomal protein S14  90.16 
 
 		 61 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0639  30S ribosomal protein S14  77.05 
 
 		 61 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000559173  hitchhiker  0.00000000926519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2844  30S ribosomal protein S14  77.05 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0517993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1079  30S ribosomal protein S14  77.05 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0946  30S ribosomal protein S14  72.13 
 
 		 61 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0139949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3315  30S ribosomal protein S14  72.13 
 
 		 61 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000449399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  62.3 
 
 		 61 aa  90.5  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  0.0000177439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0502  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 		 61 aa  88.2  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0510  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0183715  hitchhiker  0.000000000349266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0340  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0123  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000176609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0123  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0119  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6855200000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0117  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000493701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0135  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0123  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5182  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220128  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0117  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2761  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000281664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0144  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000518552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0118  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000039135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0154  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1136  ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1239  SSU ribosomal protein S14P  57.38 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.362958  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0780  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  84  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0299  ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000407212  normal  0.0939197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0701  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3900  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000205328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2894  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  60.66 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0487  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000160451  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429a  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000656242  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2389  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0860  SSU ribosomal protein S14P  57.38 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017465  hitchhiker  0.00181207 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0464  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1946  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2031  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0120  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1933  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000324715  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1924  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000576242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1955  ribosomal protein S14  60.66 
 
 		 61 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  55.74 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000971203  hitchhiker  0.00000013579 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1862  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2068  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1691  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.049488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1720  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.1  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0072  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.15286  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0411  ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4302  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604005  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1020  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00305455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0071  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.689947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000580616  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0944  ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  55.74 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3910  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0000711569  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000000564921  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1764  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000826502  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1894  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000079988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4494  ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  54.1 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1849  ribosomal protein S14  52.46 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.94553e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04110  SSU ribosomal protein S14P  54.1 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0238  ribosomal protein S14  59.02 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.267646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1198  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0428154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2646  ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>