More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0780 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0780  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
61 aa  127  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1946  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1933  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1239  SSU ribosomal protein S14P  63.93 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.362958  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2031  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1924  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0502  30S ribosomal protein S14  72.13 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0860  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017465  hitchhiker  0.00181207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1849  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.94553e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2844  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0517993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1079  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0639  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000559173  hitchhiker  0.00000000926519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1359  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000205328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0693  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1732  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000129581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0487  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000160451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0464  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429a  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000656242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000576242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 
61 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 
61 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  0.0000177439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0238  ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.267646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0994  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.106756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2761  ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000281664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4013  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000290289  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01300  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  57.38 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0490  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0863269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0946  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0139949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3315  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000449399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0299  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000407212  normal  0.0939197 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0097  ribosomal protein S14p/S29e  57.38 
 
 
61 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.316233  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1171  ribosomal protein S14  61.11 
 
 
61 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0923192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  62.26 
 
 
61 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2244  30S ribosomal protein S14  60.38 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00320341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  62.26 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2142  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  57.38 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000971203  hitchhiker  0.00000013579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3654  ribosomal protein S14  60.71 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000678184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1405  ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  77  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000324715  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1894  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000079988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0510  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0183715  hitchhiker  0.000000000349266 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0340  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3992  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
59 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116963  normal  0.878683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  76.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3710  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3900  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1305  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  68.89 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3418  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4494  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1381  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000700015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0411  ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000000564921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2052  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0017138  normal  0.052251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0000711569  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0071  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.689947  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0701  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  54.1 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04110  SSU ribosomal protein S14P  55.74 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20740  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.905824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2646  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0278  30S ribosomal protein S14  68.09 
 
 
62 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000593233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000580616  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148473  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  58.49 
 
 
61 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  54.1 
 
 
61 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1470  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000297211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1854  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.459394  normal  0.875605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6036  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  66.67 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0595  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1198  30S ribosomal protein S14  52.46 
 
 
61 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0428154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0944  ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>