40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1803 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 66 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  72.41 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  53.7 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  55.1 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  54.35 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  40.98 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  50.94 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  52.38 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  58.97 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  54.76 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  58.54 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  56.41 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 		 101 aa  47.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  62.5 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  51.16 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  41.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  55 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  42 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  46.67 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  34.48 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  40.91 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  37.25 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  44.19 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  38.3 
 
 		 123 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 		 126 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  33.93 
 
 		 201 aa  40  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 		 157 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>