21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0072 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  36.68 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  35.84 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  33.14 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2873  hypothetical protein  25.7 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  36.64 
 
 		 171 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  31.67 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  31.67 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  30.47 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  32.69 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  26.19 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.425505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  26.19 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  26.23 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1332  hypothetical protein  28.81 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1244  hypothetical protein  24.22 
 
 		 153 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  37.93 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>