16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1530 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1530  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 74 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1151  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44.83 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.340113  normal  0.0945912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3272  Cbb3-type cytochrome oxidase component  45.83 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348375  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3661  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44 
 
 		 50 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.678332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2439  Cbb3-type cytochrome oxidase component  47.92 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0735007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2113  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.75 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5232  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.75 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.346286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0732  Cbb3-type cytochrome oxidase component  64.71 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0430029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0015  Cbb3-type cytochrome oxidase component  61.29 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0018  Cbb3-type cytochrome oxidase component  51.11 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0013  Cbb3-type cytochrome oxidase component  59.38 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3855  Cbb3-type cytochrome oxidase component  37.25 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1880  Cbb3-type cytochrome oxidase component  40.91 
 
 		 63 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2420  hypothetical protein  39.58 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0694  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoQ subunit  35.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2349  Cbb3-type cytochrome oxidase component  35.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337464  normal  0.494297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>