17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0007 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0007  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.250623  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3546  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4177  hypothetical protein  33.61 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0552  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000251234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3716  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3899  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0004514  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3773  hypothetical protein  29.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0791  hypothetical protein  33.61 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0978645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3031  hypothetical protein  29.63 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0595  hypothetical protein  30.15 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0591  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0592  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396305  hitchhiker  0.00000978243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3438  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3316  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0560  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.312654  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3210  hypothetical protein  24.14 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000480541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>